​Los civiles fueron asesinados durante tres días por los bolcheviques y dashnaks-armenios. Los documentos de archivo azerbaiyano afirman que fueron masacradas 8, 10, 12 mil personas. Pero algunos documentos ingleses señalan que 1/4 de la población azerbaiyana de Bakú fue asesinada durante esos acontecimientos. Y según los datos demográficos en Bakú vivían 280-300 personas, 80-100 mil de los que eran azerbaiyanos; entonces 1/4 de la población azerbaiyana de Bakú era 20-25 mil personas. Cada año, el 31 de marzo los azerbaiyanos conmemoran el "Día del Genocidio", en recuerdo a los miles de azerbaiyanos que sucumbieron en 1918.

Después de la Revolución de Octubre del 1917, que puso fin al régimen zarista, Vladimir Lenin nombró a Stepan Shaumián, de origen armenio, Comisario Extraordinario para el Cáucaso y Presidente de la Asamblea de Comisarios del Pueblo de Bakú. El motivo de ese nombramiento fue evitar alguna posibilidad de autonomía y también proteger una de las principales fuentes energéticas de la Rusia. A principios de marzo de 1918 l partido "Musavat" ya se ha convertido en la fuerza política principal de la sociedad azerbaiyana. En estas condiciones Shaumián trató destituir de cualquier manera el "Musavat" de la lucha política en Bakú. 

El motivo del genocidio fue creado por los acontecimientos que tuvieron lugar en el barco Evelina. El 27 de marzo 50 militares azerís de División Salvaje habían llegado a Bakú desde Lenkoran en el barco Evelina para asistir al funeral de su colega Mamed Taghíyev, hijo del magnate petroleo famoso Zeinalabdín Taghíyev. El 30 de marzo de 1918, cuando grupo de militares volvieron a bordo de Evelina para abandonar Bakú, el Consejo Soviético recibió una información de que los soldados azerbaiyanos del barco estaban armadas y esperaban una señal para rebelarse contra el Soviet. A pesar de que la información tenía ninguna base, los líderes del Consejo Sovietico desarmaron el grupo musulmano, que se resistió. Sin embargo, el desarme de militares que trataban de salir de la ciudad, ha provocado la indignación de la población azerbaiyana de la ciudad, ya que los requisitos de desarme no se aplicaban a otras étnicas y partidistas existentes en la ciudad.

Los azerbaiyanos estaban preocupados por la fuerza militar creciente de los armenios en Bakú y solicitaron la ayuda de la unidad organizativa División Salvaje de Lankaran. Su llegada, por su parte creó gran preocupación de los bolcheviques y de los armenios. Los bolcheviques que oficialmente se declararon neutrales, tácitamente apoyaron a la parte armenia.

El cañón de dashnaques de los acontecimientos de marzo de 1918. Actualmente se encuentra en el Museo de la Historia de Azerbaiyán.
El 31 de marzo de 1918 se inició una matanza masiva contra la población civil azerbaiyana; los acontecimientos duraban tres días (del 31 de marzo al 2 de abril) y alrededor de 20-25 mil civiles azerbaiyanos y turcos en Bakú fueron asesinados por soldados armenios y rusos.4​ Los bolcheviques ayudando a los armenios, bombardearon al castillo antiguo de Bakú con sus buques en el mar. Fueron destruidos los minaretes de la mezquita de Tazapir y una parte del castillo de la ciudad. El 2 de abril de 1918 la dirección del Consejo de Bakú oficialmente se ha puesto de acuerdo una tregua con los azerbaiyanos, sin embargo, la matanza y el saqueo en los barrios de Bakú continuaron hasta el 5 de abril. Fue firmado un contrato sobre el reconocimiento oficial del gobierno de los bolcheviques extremistas y el desarme de los musulmanes. Por lo tanto, fue organizado un gobierno bolchevique bajo la dirección de Shaumyan en Bakú.

Las fuerzas bolcheviques dirigidas por Stepán Shaumián con apoyo de Lenin masacraron a miles civiles azrbaiyanos que se oponían al proyecto de instaurar un régimen soviético en Azerbaiyán.

Stepan Shaumián consideraba los acontecimientos de marzo el triunfo del poder soviético en el Cáucaso, el escribe:

"Los resultados de los combates son excelentes para nosotros. La derrota fue absoluta. Les dictábamos las condiciones, que incondicionalmente fueron aprobados. Se decidió el destino de Transcaucasia. En el caso de su victoria, Bakú sería declarado el capítal de Azerbaiyán y todos elementos no musulmanos serían removidos de aquí".
El consejo de Bakú provocó la guerra civil con la esperanza de destruir el poder del partido Musavat. Sin embargo, cuando el consejo pidió ayuda a Dashnaksutun en la lucha contra los nacionalistas, la guerra civil se convirtió en la masacre y los armenios empezaron a matar a los musulmanes, independientemente de su filiación política, económica o social. Sobre la alianza de Dashnak con las fuerzas de Shaumyan, M.A.Rasulzade escribe:

"El representante del gobierno bolchevique, Shaumyan saludó con satisfacción el establecimiento de un Estado autonomía de Armenia en los territorios azerbaiyanos por el Ordenanza de Lenin junto con la retiración de las fuerzas rusas de Turquía, mientras que daba la reacción amenezante a la autonomía de Azerbaiyán. Lenin con esta ordenanza encargó a las organizaciones armenios la ayuda a Shaumyan "para que el pueblo armenio deprimido realizaran sus ideas nacionales””.
En 1918 también en Shamakhi, Guba, Karabaj, Zangazur, Nakhicheván, Lankaran los armenios infligiendo un castigo a miles de personas, habían quemado los pueblos y habían destruido los monumentos históricos.

"Shamakhi sufrió por los ataques de estas fuerzas dirigidas a Ganja. La histórica mezquita de la ciudad, capital antigua de Shirvanshakhs se convirtió en cenizas. Sólo no atacaron al barrio armenio, excepto dos iglesias, se destruyeron todos los edificios en la ciudad. Lankaran, Salyan, Guba, Kurdamir y otras ciudades y distritos habían sido violados como Shamaji. No es posible imaginar la tragedia de las personas asesinadas, el honor violado de las mujeres, las casas desoladas y la riqueza robada durante esta violencia. La amenaza había estado cerca de Ganja. Por un lado Ganja estaba en peligro, y por el otro los armenios de Karabaj y bolcheviques de Bakú esbozaban un plan. No había ninguna duda de que su propósito era masacrar a Azerbaiyán y convertir en cenizas". 
El 13 de abril de 1918 fuen establecido la Comuna de Bakú, que llegó al poder tras una confrontación sangrienta con la población musulmana.

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